變種--長柄溝繁縷E. triandra var. pedicellata F. Muell. (部份學者視為獨立種)即具有延長的果柄，再加上本屬花梗之有無並非穩定之形態特徵，且可能與植物生長時的水位與形態適應有關。故三蕊溝繁縷是否應訂正為短柄花溝繁縷仍有諸多疑點。這些分類群之間的關係仍有待研究。此外，中國植物誌曾記載臺灣亦產美洲溝繁縷Elatine americana (Pursh) Arn.，但因該書未提及證據標本，故本書暫不列入。部份學者亦將美洲溝繁縷視為三蕊溝繁縷的亞種或變種，甚至視為同種。