蕨類植物的主體構造是孢子體，其中又以葉子為最主要部份，其它構造有的是太小，有的是在地下，因此並不顯眼。因此，蕨類植物的辨視及分類，需依賴葉子上的特徵。蕨類植物的構造和種子植物有些不同，源也不盡相同，因此有些名詞和種子植物有些出入，且部份相同稱呼所指未盡相同，因此本章特地將一 些在觀查蕨類植物時，常遭遇到的名詞略加說明。

　　蕨類植物中很少有對於根的描述，因為大部份的種類都為細絲狀的根，祇有少數種類的根較粗大，如觀音座蓮舅科、瓶爾小草科、鹵蕨，臺灣只有這三群蕨類植物具有較肥厚的根。觀音座蓮舅科的根比較粗且 硬，所以是用 thick、succulent（厚、肉質）形容，瓶爾小草科較軟是 succulent，而鹵蕨的根最硬，因此多以thick形容。
　此外，還有桫羅科的氣生根，卷薄類的根支體（rhizophore，或稱「根托」），以及松葉蕨由莖變態形成的假根，和槐葉蘋由葉變態的鬚狀假根。

　　蕨類植物的莖多在地表上下，或是在岩時、樹幹表面，僅少數具直立的莖。依其生長形式可分為直立莖、短直立莖、亞直立莖及匍匐莖。

1. 直立莖(erect)

　　此類莖為直立向上生長，像種子植物一樣，但是並無分枝。具此類莖之類群被統稱為樹蕨，包括桫欏科之一部份、假桫欏、過溝菜蕨、金狗毛蕨及蘇鐵蕨。

2. 短直立莖(short erect)

　　植株莖短而直立，如野小毛蕨等，很多叢生的植株都屬於此類。

3. 亞直立莖(suberect)

　　莖為節間極短的匍匐性，會斜向上生長，葉由莖的一端長出，植株多少叢生，如：鱗毛蕨、三叉蕨，蹄蓋蕨等。

4. 橫走莖(creeping)

　　橫走莖，大部份蕨類都是此形。
腎蕨是較特殊的一種，它同時具有三種形式的莖：短而直立的、長而匍匐的、塊莖。

　　蕨類植物的葉子和種子植物差異極大，因此不用leaf，而用frond稱述。真正蕨類都是大葉型的，葉身單脈不具葉隙的小葉都是擬蕨類的成員。