(3) 部份研究者為訂立變種或新學名組合所採用的形態特徵穩定性不足(如花色、擬角有無、果冠形態與果實肩角上的表面構造)；(4) 自該屬由林奈(1737)建屬開始至今，至少已有164個左右的種級分類群(包含已被處理之同物異名)被描述發表，其中有一半以上的物種被分別描述自中國、蘇俄遠東地區、朝鮮半島以及日本，然分散存於各地區的模氏標本皆未被全面性地詳細比對與考證過；(5) 菱屬的模氏種--菱(T. natans L.)與紅菱(T. bicornis Linn. f.)、四角菱(T. quadrispinosa Roxb.)、二角菱(T. bispinosa Roxb.)以及日本菱(T. japonica Flerov)等種有著歷史性的混淆，或依作者意見不同有不同的合併或地位(status)調整。然部份作者又經常發表與他種種小名完全相同的變種小名，造成分類歷史判別的困擾；(6) 部份作者對形態特徵的詮釋不一，特別是腰角(lower horn)與擬角(pseudohorn)，經常被統稱為「角」，其它發育來源不同的表面突起如雄蕊座突(deformed scar of stamen)以及花瓣座突(deformed scar of petal)亦被混淆，以致鑑定與學名的混亂；(7) 許多植物誌與文獻的異名表(synonymy)引用未依國際植物命名規約處理，造成對分類歷史的誤判與一再的錯誤引用；(8) 雖有學者已進行菱屬植物的形態數值分析與變異觀察(如Flerov(1925, 1926)、Vassiliev(1949 in Komarov, 1965)、Staszkiewicz & Wojcicki(1979)、Chung et al. (1987)、Kadono (1987)、Tzvelev(1993)、于丹(Yu, 1994)、熊治廷等(Xiong et al., 1985))，但根據局部地區之材料僅能判別該地有多少不同的分類群，卻無法判定其分類地位與歸屬是否正確。
　　關於臺灣地區的菱角種類鑑定，雖然各作者即使在分類歸屬意見上有著相當大的出入，但長年以來多半被認定有三個原生的分類群(如伊藤，1926；Raven, 1976；Hsieh, 1993；楊等，2000；萬，2000)以及一些尚未被臺灣植物誌所處理的分布記錄與引進種。由於早年的採集地點多半已被破壞殆盡，引進栽培的菱種又有逸出的現象，我們很難由現今存在的物種與少量的標本評估臺灣產菱屬植物的確實種數與分類地位。合理的分類架構則有待未來對所有歐亞大陸相關分類群的親緣關係與形態變異有更一步的瞭解後，才可能提出。因此，在本書中，我們僅就臺灣菱種鑑定的歷史變革與現況提出部份觀點與澄清，檢索表所使用的特徵皆引用自原始描述與較可靠的文獻。

　　　　　　　　　　　　　　種檢索表
1. 果實具2角，或具擬角。
　2. 果實的角下彎或平展。
　　3. 果實肩角不具倒刺，果冠大……………………1a. T. bicornis var. bicornis
　　3. 果實肩角具倒刺，果冠不明顯………………1b. T. bicornis var. taiwanensis
　2. 果實的角直，略斜上。
　　4. 果實呈菱狀三角形，二肩角角度大於90度………………6. T. pseudoincisa
　　4. 果實呈倒三角形，二肩角角度小於90度
　　　5. 肩角近種臍處略膨大…………………………………………2. T. bispinosa
　　　5. 肩角近種臍處不膨大，偶具擬角……………………………4. T. japonica
1. 果實具4角
　6. 果實短於2 cm (包括肩角) ……………………………………………3. T. incisa